甲状腺功能减退是可以遗传的，孕妇甲状腺功能减退有可能影响孩子智力发育。
无论甲亢或甲减，病情轻者均不影响怀孕，但其流产或死胎率较高，女性患者甲低时多为月经过多、过频，如不治疗，也可导致不孕。
甲状腺功能减退(甲减、甲低)、减退症，这时胎儿的影响比患甲亢更大，胎儿的流产率和围产期死亡率增高。
现在生孩子后会有甲状腺疾病筛查检查，即使有病，如能及时发现，孩子得到及时治疗就行，一般新生儿出生后20-60分钟TSH会有一个生理高峰，1-4天逐渐下降，所以最好在出生30分钟内或4-7天化验。患有甲减的孩子治疗的越早越好。
甲状腺疾病属于自身免疫性疾病，不仅有甲状腺功能的异常，且有免疫功能的异常，血清中含有高浓度的抗甲状腺球蛋白抗菌素体和抗微粒体抗体。这些抗体可通过胎盘，进入胎儿体内，导致新生儿甲状腺功能减退。
母亲产后由于免疫功能的变化，可使甲亢和甲减的病情加重。母乳具有浓缩碘的能力，通过乳汁，如甲减、慢性甲状腺腺炎，会影响乳汁向婴儿提供碘，导致婴儿碘的不足，发生甲状腺功能减退，而波及脑组织和骨骼的发育。因此这种情况，不宜母乳喂养。
