甲亢突眼多数与甲亢同时发生，但又有部分患者却在甲亢缓解、或治愈甲亢后、或发生甲减后，突眼出现、加重或恶化。如用西药他吧唑等治疗，病情好转了，但突眼却加重了，又如甲亢以碘治愈了，甚至出现甲减了，可是突眼却加重了，甚至形成恶性突眼。
还有部分人没有出现过甲亢，却出现了突眼。甲亢病人突出的表现为高代谢症候群和精神亢奋。其病多因气、火、痰、瘀交织为患，其中“火”最为突出，临床上火有实火如心肝胃火旺证，有虚火如阴虚火旺证。实火也称壮火，“壮火食气”，在病变的一定阶段可出现伤阴耗气证。
遗传因素：人类细胞相容性抗原与突眼有密切的关系，伴有突眼的甲亢患者中HLABgDR3位点阳性则明显多于无突眼的甲亢患者。
环境因素：径观察甲亢患者，发现伴突眼者83%吸烟，而无突眼者仅40%吸烟，提示吸烟有可能参与突眼的发生，此为导致甲亢性突眼的病因之一。
体液免疫：一般认为，突眼症是自身免疫性疾病。眼部可能与甲状腺一样，存在有相同的抗原决定簇，TSH受体抗原，甲状腺球蛋白-抗甲状腺球蛋白抗体免疫复合物，细菌，病毒等外来抗原的抗体等也可能在发病中起作用。
